Bosna Savaşı sırasında Markale Katliamı olarak anılan iki olay meydana gelmiştir. Birincisi 5 Şubat 1994’te Saraybosna’daki Markale Pazarı’na kalabalığın en yoğun olduğu öğle vakitlerinde Sırp birliklerinin 120 mm’lik havan topuyla gerçekleştirdiği saldırıdır. Katliamda 68 kişi hayatını kaybetmiş, 144 kişi yaralanmıştır. Sırp Cumhuriyeti Cumhurbaşkanı Radovan Karadziç, saldırının akabinde düzenlediği basın toplantısında, bombalama eyleminde hiçbir sorumlulukları olmadığını iddia ederek, “Bu katliam, Müslüman liderliğinin soğukkanlı bir cinayetidir.” demiştir. Bu katliam sırasında Sırp ordusunu komuta eden Sırp General Stanislav Galiç 2004 yılında görev yaptığı dönemde gerçekleştirdiği sivil saldırılar için 20 yıl hapse mahkum edilmiştir.

İkinci Markale saldırısı 28 Ağustos 1995’te gerçekleştirilmiş, havan toplarıyla düzenlenen saldırıdan iki gün sonra NATO birlikleri düzenledikleri bir seri operasyonla Sırp askeri hedeflerini vurarak teslim olmaya zorlamıştır.

Markale katliamları Sırp ve Hırvatların Bosna Savaşı boyunca Boşnak Müslümanlara karşı giriştiği soykırıma varan katliamlardan sadece ikisidir. 14 Aralık 1995’te Bosna Savaşı’nı bitiren Dayton Anlaşması imzalandığında dört yıl süren yıkıcı savaşın sonunda 250.000’in üzerinde Boşnak Müslüman öldürülmüş, yüz binlercesi yerinden edilmiştir.